Nedostatak magnezija povezan je sa koronarnim, srčanim oboljenjima (aritmija) a moguće je da se pojačanim taloženjem kalcija može pojaviti stvaranje ugrušaka u srcu i mozgu kao i pojačano taloženje u bubrezima, krvnim žilama i srcu.
Simptomi deficita su tikovi, grčevi, napetost i bolnost mišića, glavobolje, stezanje u grudima, konstipacija; urinarni spazmi; menstrualni grčevi; fotofobija, i osjetljivost na glasnu buku; što dolazi od tenzije mišića stapediusa u uhu; vidno je pogođen centralni nervni sistem – nesanica, anksioznost, hiperaktivnost i nemir sa konstantnom pokretnošću, te predmenstrualna iritabilnost. Kod kardiovaskularnog sistema se javljaju palpitacije, srčane aritmije, visoki krvni tlak.